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對於漁民來說，也不能輕忽一張公海漁業執照代表的意義，其相對表示承諾願意遵守國家的各項管理規定，包括繳交漁獲報表、裝設漁船監控系統等等，也必須隨著管理趨勢改變而調整做法，而非一成不變。
● 港口檢查
漁船的主要活動範圍在海上，只有在卸魚、整補的時候會進港，所以，港口就成了少數能夠進行檢查的地方。特別是遠航到三大洋作業的漁船，更必須有在國外港口接受外國官員檢查的準備。
由於國情不同，各國港口檢查規定也不盡相同，以鯊魚翅卸售來說，因為有許多區域性國際漁業組織規定不可以對於鯊魚割鰭棄身，而在港口初次卸魚的鯊魚翅不得少於鯊魚肉的5%。因此，有些國家嚴格要求比例，有些國家甚至要求鯊魚鰭身不得分離，而對於違規者，重則甚至會處以數十萬美元的重罰。
港口檢查項目通常包括以下幾點：
1. 執照等證明文件：最基本者為船舶執照以及漁業執照，船舶執照的目的在於確保船舶適航性，漁業執照的目的則在於確認該船已被其船旗國授權進行漁撈作業，至於幹部船員也應該依據船型有一定的比例，此部分主要基於漁船作業合法性以及安全性。
2. 漁撈日誌：漁船船長的基本義務為填寫報表，所以船上應該都有紀錄完整的漁獲日誌，包括作業地點、漁獲魚種等等。
3. 設備及漁獲：船上的漁具是否符合規定，沒有流刺網等禁止漁法之漁具？此外，檢查員會檢查船上的漁獲物，看有沒有禁止捕撈的物種，或者有前述提到鯊魚翅與鯊魚身比例不符的問題。
如果被檢查出有違禁的作業或漁獲物，港口國家最可能的處置是通報漁船船旗國處理，至於漁獲，就會被禁止在當地卸售，倘若違反有關鯊魚割鰭棄身等相關規定，則還會受到罰款等處分措施。所以，漁民在進港前，最好先對該港口的管理及檢查措施先了解並妥善準備，接受港口國官員檢查也應該慎重應對，至於語文的問題，則通常透過當地代理商作為溝通橋樑，以避免因為語文不通而有所誤解。
對於已經有前科的黑名單漁船，港口國就可以直接禁止進入該國港口，臺灣也公告禁止區域性漁業組織白名單以外之延繩釣漁船到我國漁港進行卸魚或整補。
● 貿易通關
您或許不知道，漁產品是全球貿易價值最高的食品，每年總產量有40%進入國際貿易，是許多國家的重要經濟來源。因此，透過貿易措施進行掌控，對於許多高價物種，是相當有效的工具。
作為漁業管理的最後一道關口， 市場國應該針對已經被區域性漁業組織管制之魚種，要求各種貿易證明文件，例如已被國際間嚴格管制的美露鱈（toothfish）、地中海黑鮪以及三大洋的大目鮪等等，該漁船就必須明列國際組織的白名單，漁獲物也必須有船旗國核發的產地證明書，甚至由國際組織觀察員簽核的轉載申報書，證明該批漁獲物並非非法捕撈，才能進口。
如果一艘船因為違規被列為黑名單，則該船的漁獲就會被其他國家禁止進口，大西洋鮪類資源保育委員會（ICCAT）的黑名單最高峰期曾達297艘；只是，許多黑名單上的漁船往往很快的轉往其他國家或者換船名，使得黑名單制度成效有限，因此，區域性漁業組織只好改採白名單制度，規定只有白名單上的漁船才能捕撈並銷售一定魚種之漁獲物。
如果一個國家因為漁船違規作業嚴重，卻又沒有採取管理措施，則這個國家就可能被列為區域性漁業管理組織的黑名單—貿易制裁名單，此舉將使得該國家在該水域作業漁船所有相關魚種漁獲都會被禁止進口。過去大西洋就曾經制裁過許多國家，不過目前多數已被解除制裁，僅剩玻利維亞以及喬治亞仍列在制裁之列。
海上的MCS
比較起來，海上的MCS難度以及所需經費就高得多了，主要有以下幾種：
● 執法觀察員
由於多數船長或因忙於作業，對於漁獲報表的填寫總會有疏漏之處，為了解實際上的作業狀況，許多國家都派遣觀察員上船蒐集漁獲資料，來校正漁獲資料，或者作為資源評估的參考。因此，多數觀察員制度的目的都以科學任務為主，臺灣自2002年以來所執行的遠洋漁船觀察員制度亦然。而許多國家也開始要求各國派遣觀察員蒐集資料，進而規範資料蒐集的種類，只是大部分也都侷限在科學性質。